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qPCR實驗之核酸提取MIQE明確的要點詳解

瀏覽次數(shù):1636 發(fā)布日期:2022-6-22  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責任自負

前言

MIQE是描述評估qPCR實驗所需的最小信息,該指南是稿件投稿時需要同時提交的一個清單。通過作者提供相關的實驗條件和實驗特點,審稿人可以評價實驗所用方法的可靠性。另外提供詳細的實驗所用試劑、序列和分析方法,其他研究人員可以利用這些信息進行重復實驗。

對于核酸提取MIQE有明確要求兩點——實驗組與對照組的定義及每一組的樣本數(shù)量。

無論采用手工法還是試劑盒,只要符合MIQE的要求并實現(xiàn)良好的可操作性和重現(xiàn)性,就是合理客觀的技術方法。MIQE在該部分操作中的要求又分為兩大塊——樣本描述和核酸提取方法。


樣本描述

▶  樣本采集和處理的方法描述

▶ 樣本的來源描述(宏觀解剖還是激光顯微切割)

▶  樣本是如何即時處理(保存條件及時間)

▶  冷凍樣本的冷凍方法和時間


核酸提取

采取的提取方法:

1)手工法:小批量經(jīng)濟型

2)自動化儀器:大批量高效型
 

按獲取的物質(zhì)可分為DNA和RNA:

◆ DNA:適合拷貝數(shù)變異、SNP分析等實驗

◆ RNA:適合基因表達、長非編碼RNA等實驗

圖源:網(wǎng)絡,侵刪
 

按提取方法分為化學法和機械破碎法:

◆ 化學法:適合采用堿裂解法的樣本,質(zhì)粒提取、菌類的提取

◆ 機械破碎法:比較堅硬有一定韌性的物質(zhì),動植物組織

更推薦使用合適的商品化的核酸提取試劑盒,流程標準化程度更高,質(zhì)量更容易得到保證,這樣在方法描述時可以更簡單一些,直接引用試劑盒的生產(chǎn)廠家、貨號和名稱即可。


DNA酶或RNA酶的處理細節(jié):

基因表達實驗中,RNA模板如果存在DNA污染,會嚴重干擾最后的結(jié)果。因此提取RNA時要加入DNA酶將DNA消化掉,工作濃度、處理溫度和時間要加以說明,同時也要加入RNase抑制劑提供保護。使用柱純化試劑盒提取RNA時也可以在柱上進行DNA消化。同樣的,提取DNA時也要將RNA消化掉,盡管殘留RNA對DNA為模板的qPCR實驗影響小得多。

 

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☑  數(shù)據(jù)可靠性:連續(xù)1000次實驗后,結(jié)果高度一致。

☑  應用靈活性:提供多種qPCR應用分析。

☑  流程智能化:中英文用戶界面,觸控操作,可多機聯(lián)用。

☑  在線便捷性:主機可獨立運行qPCR程序,數(shù)據(jù)可USB、Wi-Fi等網(wǎng)絡傳輸。

發(fā)布者:艾普拜生物科技(蘇州)有限公司
聯(lián)系電話:0512--86860010
E-mail:info@aperbio.com

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