NextGenPCR系統在猴痘最高警戒級別篩查與預防的應用

瀏覽次數：1051　發布日期：2024-8-20　來源：本站　僅供參考，謝絕轉載，否則責任自負

MPOX（又名。猴痘（MPXV）是一種由猴痘病毒引起的傳染病。它會導致疼痛的皮疹、淋巴結腫大和發燒。大多數人完全康復，但有些人會病得很重。任何人都可能患上猴痘。目前，世界多個地區發生了多國猴痘疫情。猴痘病毒感染的確認基于核酸擴增檢測（NAAT），使用實時或常規聚合酶鏈反應（PCR）檢測病毒 DNA 的獨特序列。PCR可以單獨使用，也可以與測序結合使用。

猴痘病毒變異株監測，使用NextGenPCR®文庫制備進行納米孔測序

測序可以跟蹤病毒的傳播以及可能使病毒更具傳染性或危險的任何突變。NextGenPCR測序試劑盒與NextGenPCR設備相結合，可提供超快的納米孔測序。該試劑盒還可以與其他PCR設備配合使用。NextGenPCR設備已被證明具有超快且非常精確的特點，可為納米孔測序產生最終質量的擴增子。

對人畜共患猴痘病毒（MPXV）感染進行快速基因組監測可以為了解病毒的地理/人口傳播提供有價值的見解，并指導公共衛生干預措施。在當前的MPXV測序方法中，從樣品中分離的核苷酸直接在納米孔測序儀上進行測序。現有方法效率低下，因為它的基因組覆蓋率低，目標片段的測序深度低，而且由于樣本無法進行多路復用，因此成本高昂。為了幫助實驗室進行MPXV基因監測工作，Molecular Biology Systems開發了一種超快文庫制備方案，用于分析樣本中的MPXV基因組。190kb MPXV 基因組的擴增是通過使用基于 PCR 的 2.5kb 片段（總共 88 個擴增子）的擴增子來實現的。使用NextGenPCR®超快PCR化學試劑，可在42分鐘內完成方案的完整PCR循環程序。

該實驗設置是一種使用NextGenPCR和Oxford Nanopore技術的組合對猴痘病毒全基因組進行測序的方法。該實驗旨在提供猴痘病毒的快速基因組監測，這有助于指導公共衛生干預措施。這實驗設置與現有方法相比具有幾個優勢，例如更快的實驗流程時間、更高的靈敏度和更低的成本。該方案還成功應用于對荷蘭和美國患者的猴痘病毒基因組進行測序。

愛爾蘭都柏林國家病毒參考實驗室的高級臨床科學家邁克爾·卡爾（Michael Carr）教授進行了一項全國性研究，以闡明猴痘病毒（MPXV）在愛爾蘭的進入和傳播。他使用的方案利用定制設計的 NextGenPCR® MPXV 引物池（貨號 #50025）進行 PCR 平鋪，使用戶能夠擴增完整的 190 kb MPXV 基因組，然后可以進行完整測序。使用下一代測序分析所得擴增子，以準確確定目前在愛爾蘭傳播的 MPXV 菌株。有了這些數據，卡爾實驗室能夠為愛爾蘭的決策者提供關鍵信息，以預防未來可能爆發的猴痘疫情。

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