Dharmacon文庫在RNAi文庫篩選的應用

瀏覽次數：1912　發布日期：2020-6-2　來源：本站　僅供參考，謝絕轉載，否則責任自負

1.什么是文庫？

――大幅提高研究效率的利器

以往的實驗室研究中，無論是尋找新基因的功能、探索已知基因致病的機制、解析復雜信號通路網絡、探索疾病發生發展的機制，藥物敏感性測試或者是尋找藥物開發的新靶點，科研工作者們往往是圍繞著潛在的單個目標基因進行改造，包括針對該基因的過表達、沉默、敲除、激活、修飾、突變等操作。這種研究方式雖然具有明確的目的性，但效率無法得以提升，且無法對抗研究方向判斷錯誤、或技術的不熟練、或操作步驟復雜進而引起失誤帶來的風險。同時，基因與基因之間具有協同作用等復雜的網絡關系，使得對單個基因的研究，往往無法獲得明確的實驗結論，從而錯失了尋找基因新功能的發現。Dharmacon文庫提供了一種批量研究基因功能的工具，支持從全基因組庫、成藥性基因庫、藥靶基因庫、各基因家族庫、客戶定制基因庫以及單個基因層面，研究基因與疾病、表型、分子機理對應的關系。近年來隨著高端酶標儀、高通量顯微鏡、自動化流式細胞儀、高內涵等設備的普及和技術更新，批量的基因研究方法趨向于成熟，Dharmacon文庫在各個領域中得以廣泛應用，相關研究成果被發表在上千篇高質量的CNS 文獻中。

2.文庫的種類

作為研究工具，Dharmacon 在進行產品開發的時候，充分考慮不同的研究領域、方法學、研究經費對產品的需求，提供多種形式和規格的產品，以期所有的科研工作者都有機會受惠于這項技術革新帶來的紅利，獲得高質量數據和加速科研進程。按照對基因改造的需求不同，Dharmacon 文庫分為：基因沉默文庫，基因編輯文庫，基因過表達文庫，miRNA文庫。本文主要介紹基因沉默文庫

3.基因沉默文庫的應用案例

A――尋找新基因的功能

B――探索已知基因致病的機制

C――解析復雜信號通路網絡

D――尋找藥物開發的新靶點

E――探索疾病發生發展的機制

F――藥物敏感性測試

4.基因沉默文庫的種類

覆蓋基因研究的范圍（以下數據隨時更新）：全基因組、成藥性基因、藥靶基因、各基因家族、客戶定制基因組合（20個基因以上）
Genome、Cell Cycle Regulation、Cytokine Receptors、Deubiquitnating Enzymes、DNA Damage Response、Drug Targets、Druggable Genome、Epigenetis、GPCR、Ion Channels、Membrane Trafficking、Nuclear Receptors、Phosphatase、Proteases、Protein Kinase、Serine Proteases、Transcription Factors、Tyrosine Kinase、Ubiquitin Conjugation Subset #1、Ubiquitin Conjugation Subset #2、Ubiquitin Conjugation Subset #3、Lincode siRNA
針對siRNA基因文庫，我們可提供siGENOME、ON-TARGETplus、Accell以及Lincode siRNA四種文庫類型，應用不同的修飾技術以滿足不同客戶的需求。選擇方法可參考下圖：

5. 基因沉默文庫的選擇

--shRNA慢病毒載體

覆蓋基因研究的范圍（以下數據隨時更新）：全基因組、成藥性基因、藥靶基因、各基因家族、客戶定制基因組合（20個基因以上）
Whole Genome、Angiogenesis、Apoptosis、Cell Cycle Regulation、De-ubiquitinating Enzymes、 DNA Damage Response 、Drug Targets、Druggable Genome、Epigenetics、GPCR、Ion Channel、Kinase、Membrane Trafficking、Nuclear Receptor、Phosphatase、Proteases、Protein Kinase、Rest of Genome、Transcription Factors、Ubiquitins、Ubiquitin Conjugation(subset 1/2/3)、Ubiquitin Ligase
針對shRNA基因文庫，我們可提供SMART Vector、GIPZ、TRIPZ以及經典的TRC shRNA文庫類型，不同的啟動子和熒光標記，優化的載體結構滿足您的不同需求。選擇方法參考下圖：