植物發育生物學是研究植物個體發育規律及其調控機理。高等植物個體發育從受精開始，通過細胞增大、分裂、分化和凋亡；經過胚胎發生，器官形成，開花及授粉受精等，形成一個非常復雜而有序的過程。這一個體發育過程既受控于植物個體的基因型，也是其內在遺傳機制同環境條件相互作用的結果。對這一發育過程中的基因表達模式及其調控機理的研究，尤其是從分子、細胞、器官到整體不同層次上開展研究工作，已成為此領域研究的重要發展趨勢。植物在整個生命過程中不斷從位于器官尖端或成熟組織之間的分生組織產生新的組織和結構。因此，有生命的植物總是具有胚組織。相比之下，動物胚胎將在很早的時候產生出生命中所有的身體部位。當動物出生（或從卵中孵出）時，它的所有身體部位都會變得更大，更成熟。

除了通過細胞分裂來生長之外，植物還可以通過細胞伸長來生長。當單個細胞或一組細胞生長更長時，會發生這種情況。并非所有植物細胞都會長到相同的長度。當莖的一側的細胞比另一側的細胞更長，更快地生長時，莖將彎曲到生長較慢的細胞的一側。此定向生長可以如向光性，向地性，向水性和向觸性等。

植物的生長和發育是由特定的植物激素和植物生長調節劑介導的。內源激素水平受植物年齡，抗寒性，休眠和其他代謝條件的影響；光周期，干旱，溫度和其他外部環境條件；和外部來源的植物遺傳因素。

植物的形式和結構表現出自然變異。盡管所有生物個體之間都有差異，但植物表現出另一種類型的變異。在單個個體內，重復的部分在形式和結構上可能與其他類似部分不同。這種變異最容易在植物的葉子上看到，盡管其他器官，例如莖和花可能顯示出相似的變化。造成這種變化的三個主要原因：位置影響，環境影響和不成熟。

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生物鐘（Circadian clock）：

 細胞骨架（Cytoskeleton）：

 開花（Flowering）：

 離子代謝（Ion metabolism）：

 脂質代謝（Lipid metabolism）：

 光形態發生（Photomorphogenesis）：

 衰老/細胞死亡（Senescence/Cell death）：

 信號轉導（Signal transduction）：

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