1、水池和站臺：對于水池的大小，存在一個人為選擇的問題，看起來應該統一標準，其實并不容易。但是有個原則就是水池不能太小，站臺也不能太大。Morris最初（1981年）用于大鼠的水池是直徑1.32米、高為0.6米，水池的水深為0.40米;但后來（1984年）改為直徑2.14米、高0.4米，水池的水深為0.25米。對于小鼠的實驗水池，文獻中介紹的迷宮直徑差異巨大，小到0.6米, 大到2.0米。一般而言，過小的水池使小鼠爬上平臺的偶然性增加，任務難度減小。過大的水池會使小鼠游泳路徑延長，體力消耗過大，爬上站臺的機率減少。現在國內文獻中所用水迷宮水池大多數為大鼠1.6m或1.8m居多，而小鼠一般為1m或1.2m，高0.5m。站臺一般為圓形，直徑可分為大鼠12cm,小鼠6cm,表面粗糙，高度一般為30cm。國外文獻中所用水迷宮水池大多數為大鼠1.8m或2.0m居多，高0.6m,站臺直徑10cm；而小鼠一般為1m到1.5m，高0.3m站臺直徑5cm。

2、水溫：水的溫度要求實驗過程中恒溫。大鼠溫度范圍一般為25± 1℃，小鼠可能低些在18~22℃。有文獻報道，對小鼠進行了水溫對迷宮成績影響的觀察，結果發現27~28℃組的小鼠成績最差，而17~18℃組和21~22℃組小鼠的學習成績沒有區別，所以，我們推薦小鼠水迷宮的實驗用21~22℃水。水溫對潛伏期影響很大，特別是大鼠，如果溫度過高，大鼠在游幾次后漸漸適應了迷宮環境，它就會把迷宮當“浴盆”了，放進去以后，就漂浮不動；如果水溫過低，大鼠體溫下降很快，體力也會耗散太多，大鼠游泳能力不能堅持很久，就會出現游幾次潛伏期突然增大的現象。甚至有些老鼠會出現較明顯的應激反應，比如說會出現抽筋，腹瀉現象。水溫一般保持25度左右，另外氣溫也會導致水溫偏差過大，應人為的調節水溫。所以就要求在水池的底部裝有可以恒定保持水溫的加熱棒或者其他加熱裝置了。

3、光源：要保證水池水面上沒有光影，主要是要避免光線在水面的反射問題，以免留在水面的光照影子被軟件的采集系統將光影和鼠的影子混淆；如果是白色的水池背景，就可以在水池上方用兩根條形的發散日光燈，這樣可以減少反射光在水面的背影；如果是黑色的水池背景，就在水池四個象限的上方放置4個60瓦的燈泡或25瓦的管燈，不用功率特別大的燈。燈泡的高度應該足夠高，不能被攝像頭捕獲到。另外還可以在水池四周裝一圈簾子（顏色一般是黑色、淺藍色或者白色），這樣可以將光的影子擋住，又保持一定的透光度。同時也可以減少外界的人站在水池旁邊某個地方或走來走去，對大鼠形成一個不定的空間參照物。

4、空間線索（參照物）：水池應該置于一個較大的房間內，池壁上懸掛兩個以上物體作為近距離視覺參照物，并在水池外房間內有多種遠距離視覺參照物。比如幾何圖形（正方形、三角形、圓形等）懸掛于水池以外的墻上，高度是必須讓大小鼠在游泳的時候看的見的范圍，所以應該在其視平線以上，這些幾何圖形可以是寬5cm至15cm塑料板制成，高度是必須高過站臺,可以用1m的線掛在水池周圍；這些幾何圖形一般涂成黑色，因為嚙齒類動物對黑色比較敏感；這些幾何圖形一般不少于3個。另外實驗室環境是一個十分重要的因素,實驗室的設備、儀器、工作臺、椅子、門窗和燈具等陳設的位置和實驗人員進行實驗操作時所站立的位置都可能被大小鼠看見，如果移動會影響實驗結果。因為動物有時會常常利用實驗室內固有的環境作為它搜索目標時的參照物。