細胞收集,基因組DNA提取
熒光弓|物PCR擴增21個str位點
產物經測序儀電泳,獲得細胞基因分型結果
結果與ATCC、DSMZ、JCRB和RIKEN等細胞庫比對和分析,廈門市逸漠生物科技有限公司">
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細胞收集,基因組DNA提取 熒光弓|物PCR擴增21個str位點 產物經測序儀電泳,獲得細胞基因分型結果 結果與ATCC、DSMZ、JCRB和RIKEN等細胞庫比對和分析
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細胞系錯誤鑒定問題已有50年歷史,基于國際細胞庫的分析數據顯示:1984年細胞錯誤鑒定率為35%,1999年為18%,直到最近幾年,應用于生物醫學領域的細胞系需要鑒定的問題仍然很少有人關注。
近年來,大量研究表明 STR 基因分型 方法是進行細胞交叉污染和性質鑒定的最有效和準確的方法之一,STR基因分型應用于細胞鑒定已被ATCC等機構強烈推薦。美國的ATCC 細胞庫、德國的DSMZ細胞庫以及日本的JCRB細胞庫等為STR 分型提供了各細胞株的數據供比對。
STR ( Short Tandem Repeat, 短串聯重復序列)基因分型技術是細胞身份鑒定最準確有效的方法,被ATCC、ICLAC等權威機構認定為細胞鑒定的金標準。STR基因位點由長度為3~ 7個堿基對的短串連重復序列組成,廣泛存在于人類基因組中,被稱為細胞的DNA指紋。通過對這些STR位點的檢測,將檢查結果與專業的STR數據庫比對,從而確定被測細胞的真實身份,或判斷被測細胞是否與某些細胞,發生交叉污染。
人源細胞STR分型(cell line STR genotyping),是選用D19S433、D5S818、D21S11、D18S51、D6S1043、D3S1358、D13S317、D7S820、D16S539、CSF1PO、PentaD、vWA、D8S1179、TPOX、PentaE、TH01、D12S391、D2S1338和FGA等19個具有高度多態性基因座和一個性別基因位點Amelogenin對人源細胞進行STR分型檢測。根據STR分型結果對細胞的生長狀態(是否存在交叉污染)和細胞的株系進行確認的技術手段。
人源細胞STR位點信息 | ||||
D5S818 | D13S317 | D7S820 | D16S539 | VWA |
TH01 | AMEL | TPOX | CSF1PO | D12S391 |
FGA | D2S1338 | D21S11 | D18S51 | D8S1179 |
D3S1358 | D6S1043 | PENTAE | D19S433 | PENTAD |
細胞系錯誤鑒定所造成的后果
► 細胞系的損失
► 時間和金錢的損失
► 在公眾領域(文獻、專利等)提供錯誤信息
► 造成實驗結果不一致或不可重復
何時需做細胞STR鑒定
►發表文章或申請課題經費前
►使用細胞進行臨床治療(試驗)前
►準備凍存保種或已凍存多年的細胞
►一個涉及到細胞試驗項目開始/結束時
►新得到的細胞或實驗室傳5代以上的細胞
►細胞系表現不穩定或結果與預期差別較大
►文章發表或常規定期鑒定
周期報價周期:1 周
報價:800 元/樣
檢測流程1.確定STR位點,設計實驗方案,包括熒光標記的選擇,引物的設計、合成和標記,熒光分子量內標的選用等。
2.按照所設計的實驗方案完成熒光PCR,利用瓊脂糖電泳檢測結果;若PCR產物特異性不夠,將進行優化。
3.PCR產物通過ABI 3730XL測序儀器進行毛細管電泳檢測,獲得擴增片段大小的數據
4.用GeneScan 3.0/GenoTyper 2.0或GeneMapper 3.2等軟件對收集到的數據進行處理分析,將產物片段大小、數量多少的信息轉化成直觀準確的波形圖譜,為下一步進行關聯分析或連鎖分析等遺傳分析提供可靠的數據。
服務內容細胞收集,基因組DNA提取
熒光弓|物PCR擴增21個str位點
產物經測序儀電泳,獲得細胞基因分型結果
結果與ATCC、DSMZ、JCRB和RIKEN等細胞庫比對和分析
樣品要求1. PCR產物或基因組DNA:濃度≥200ng/ul,總體積≥20ul,OD260/280在1.7至2.0之間;新鮮組織樣品:總量≥100mg的新鮮組織樣品或1~2ml血液樣品
2. PCR產物或基因組DNA請提供樣品的電泳檢測圖
3. 由于在實驗過程中,可能會出現某些STR位點難以檢測的情況,建議提供3~4個備選STR位點
4. 建議使用6FAM, VIC, NED以及PET四種熒光標記
5. 為盡量避免多種熒光信號的相互干擾,不建議同管檢測使用的熒光多于2種,多種熒光同管檢測,PCR產物大小需相差50bp以上
6. STR檢測中常會出現一些比正常產物短2~4個堿基的峰,這是由截斷PCR造成的,屬于正常現象,并不會影響實驗結果的分析。
您的細胞系認證服務 STR 概況報告包含簡單易懂的STR等位基因表
支持每個位點的等位基因調用的電泳圖
結果的綜合解釋
STR 分型圖譜和細胞鑒定結果的書面報告 (中英文報告)
公司優勢通用熒光引物,大幅降低3730實驗成本
提供21個str位點選擇,極大提高鑒定的分辨率
數據分析基于3730測序平臺,結果穩定可靠
可提供英文報告,用于文章發表
實驗周期短,價格優惠,售后服務完善
項目案例以PLC/PRF/5細胞為例,進行STR鑒定
人源細胞STR位點信息
STR分型圖譜
STR檢測結果
STR分析已廣泛應用于遺傳制圖、連鎖性分析、親子鑒定、疾病基因定位和物種多態性研究等諸多領域。高度多態的微衛星還可以用來在人群進行個體識別。刑事案件的偵破離不開法醫學的幫助,其中Y-STR檢測手段在鑒定中發揮的作用尤為突出。
Y-STR檢驗是法醫學對精子的一種DNA檢測手段,Y-STR基因座是位于男性Y染色體上的人類多態性STR位點,一般情況下,只有男性個體才有Y染色體,因此,Y-S T R具有男性遺傳,男性特異性的特點。Y-S T R即可作為性別鑒定的依據,同時在法醫學精斑及混合斑檢驗中發揮著重要作用。Y染色體為男性個體特有且呈現男性伴性遺傳,Y-STR檢測技術可以對嫌疑人或被害人的身份認定進行有效確認,故作為一種補充檢驗技術,此項技術在個體識別、親子鑒定、血緣關系鑒定及族譜DNA分析等方面具有十分重要的研究和應用價值。