SWATH定量蛋白組學服務
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服務商: 北京百泰派克生物科技有限公司 | 查看該公司所有服務 >> |
SWATH(Sequential Window Acquisition of all Theoretical fragment ions)由ETH Zürich的Dr. Ruedi Aebersold團隊與AB SCIEX共同研發的一項全新的質譜采集模式技術。SWATH作為一種DIA (Data Independent Acquisition)技術,將整個質譜掃描質量范圍分為若干小窗口,依次對每個窗口的所有離子進行碎裂,使其能夠對掃描區間內的所有肽段離子進行高速一級MS掃描再進行二級MS/MS分析。因此,SWATH能夠對復雜樣品中幾乎所有可檢測的分子進行定量測定。SWATH綜合了shotgun proteomics高通量檢測的特點與精準定量分析的優勢,是真正意義上的全景質譜檢測手段MS/MS ALL。 百泰派克公司采用AB SCIEX Triple-TOF 5600 plus高分辨質譜系統,具有快速掃描速度和串聯四極桿質譜系統的定量靈敏度能力,集質譜系統的高分辨、準確質量數穩定性、高靈敏度和高速度掃描特點于一身,推出SWATH定量蛋白組分析服務技術包裹,您只需要將您的樣品寄給我們,我們會負責項目后續所有事宜,包括蛋白提取、蛋白酶切、肽段分離、質譜分析、質譜原始數據分析、生物信息學分析。
SWATH定量蛋白組學服務技術平臺SWATH定量蛋白組學服務技術平臺
SWATH技術特點• 定量鑒定復雜的樣品中所有分子,包括低豐度蛋白和肽段
• 定量準確度高:定量準確度與MRM技術相當
• 通量大:一次實驗可定量檢測到2000種以上蛋白
• 完整全面信息存儲,能夠存儲MS,MS/MS每個峰值的數據,同一樣本無需進行重復檢測
• 無需像MRM技術需要提前調試樣品測定方法
對于復雜樣品定量分析主要的問題往往來自于樣品本身高豐度蛋白的干擾,從而難以鑒定到低豐度蛋白。許多DDA(Data Dependent Acquisition)質譜鑒定方法,都是在MS級別鑒定肽段,優先篩選MS信號強的肽段進行二級碎裂,因此低豐度的肽段不易被選擇進行二級分析。而SWATH/DIA則是對樣品中的所有分子無差別地進行分析,并一次性將所有肽段的MS,MS/MS數據進行儲存,以保證不遺漏任何可能重要的數據。總的來說,SWATH極大地提高了定量分析的可信度,并能夠高效測定復雜樣品中豐度極低的蛋白分子。
DDA與SWATH/DIA質譜分析的對比
另外,相比MRM需要根據待檢測的目標分子進行檢測方法優化,SWATH無偏差分析所有分子,不需要提前對檢測方法進行優化,只需要在已獲得檢測數據的基礎上對分析方法進行優化即可。因此,SWATH分析能夠為您極大得縮短檢測分析的周期。
SWATH定量蛋白組學服務樣品要求SWATH定量蛋白組學服務樣品要求
生物信息學分析• SWATH譜圖分析,蛋白質數據質量評估
• 多組分樣本PCA分析
• 鑒定的蛋白功能注釋:GO功能注釋、 KEGG功能注釋和COG功能注釋
• 差異表達蛋白統計分析:韋恩圖、火山圖(Volcano Plot)
• 差異表達蛋白聚類分析:層次聚類、K-means聚類
• 差異蛋白相互作用分析:基于STRING數據庫進行蛋白互作網絡分析
在最終的技術報告中,百泰派克生物科技會為您提供詳細的中英文雙語版技術報告,報告包括:
1. 實驗步驟(中英文)
2. 相關的質譜參數(中英文)
3. 質譜圖片
4. 原始數據
5. 蛋白差異水平分析
6. 生物信息學分析
您只需下單-寄送樣品
百泰派克一站式服務完成:樣品處理-上機分析-數據分析-項目報告
DIA定量蛋白質組學
定量蛋白組分析
4D蛋白質組學
基于Label Free的定量蛋白組分析
基于標簽的蛋白質定量技術-iTRAQ,TMT,SILAC
TMT/iTRAQ/MultiNotch定量蛋白組學分析
2D-DIGE定量蛋白質組學
靶向蛋白質組學
MRM/PRM定量蛋白組學分析
絕對定量分析(AQUA)
蛋白質組學生物信息學分析