環(huán)狀RNA（circRNA）是一類特殊的非編碼RNA分子，與傳統(tǒng)的線性RNA（linear RNA）不同，circRNA分子合呈封閉環(huán)狀結(jié)構(gòu)，且不受RNA外切酶影響，表達(dá)更穩(wěn)定，不易降解。華大推出環(huán)狀RNA高通量測(cè)序服務(wù)，可進(jìn)行環(huán)狀RNA的鑒定以及環(huán)狀RNA與miRNA‘’海綿效應(yīng)‘’分析， 可實(shí)現(xiàn)ceRNA（competing endogenous RNAs，內(nèi)源競(jìng)爭(zhēng)RNA）機(jī)制等研究。可應(yīng)用在物種環(huán)狀RNA表達(dá)譜構(gòu)建，環(huán)狀RNA疾病生物標(biāo)記開發(fā)，環(huán)狀RNA作用機(jī)制研究等方面。

技術(shù)優(yōu)勢(shì)

信息分析內(nèi)容

一、標(biāo)準(zhǔn)信息分析

      1. 基本數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)

        1.1去除接頭序列、低質(zhì)量序列得到clean data

        1.2與核糖體數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)，去除核糖體RNA數(shù)據(jù)

      2. 環(huán)狀RNA預(yù)測(cè)鑒定

      3. 環(huán)狀RNA所在線性基因注釋

      4. 環(huán)狀RNA在基因組上的定位

      5. 環(huán)狀RNA表達(dá)定量分析

      6. 樣品(組)間表達(dá)差異分析

二、高級(jí)信息分析

      1. 差異環(huán)狀RNA來源的基因GO功能及富集分析

      2. 差異環(huán)狀RNA來源的基因Pathway功能及富集分析

      3. 環(huán)狀RNA與miRNA互作分析(適用于人/小鼠物種)

華大科技于2012年完成整合，致力于成為全球生命科學(xué)研究機(jī)構(gòu)的首選科技服務(wù)商，為從事生命科學(xué)研究的機(jī)構(gòu)和企業(yè)提供高質(zhì)量、行業(yè)領(lǐng)先的基因測(cè)序、質(zhì)譜、合成生物學(xué)、生物數(shù)據(jù)庫(kù)、云計(jì)算等標(biāo)準(zhǔn)化的技術(shù)服務(wù)和綜合的全流程解決方案。 目前，公司服務(wù)已經(jīng)覆蓋了全球100多個(gè)國(guó)家和地區(qū)，擁有7,000多位合作單位，為25,000多位行業(yè)聯(lián)系人提供了杰出技術(shù)支撐與服務(wù)，更通過深度合作完成了一系列大型基因組科研計(jì)劃和國(guó)際多邊合作項(xiàng)目。科研積累上，截至2020年9月底，公司累計(jì)參與發(fā)表近1,500篇文章，其中CNNS 120+。截止2022年3月，華大自主測(cè)序平臺(tái)DNBSEQTM 助力發(fā)表2,013+篇高質(zhì)量文章，影響因子合計(jì)8,800+，并實(shí)現(xiàn)CNS三大主刊發(fā)文。