研究內容
全長轉錄組基于PacBio的單分子實時測序技術,可以直接得到全長轉錄本信息,無需組裝,更大限度的保證了轉錄組測序結果的準確性,補充已注釋基因組的基因注釋結果,發現新的基因和轉錄本,鑒定可變剪接、基因融合現象、APA位點(Alternative polyadenylation,選擇性多聚腺苷化位點)等,并改善基因表達定量。
對于無參考序列的物種,全長轉錄組測序可以構建高質量的基因集,為后續物種的功能研究奠定基礎。
對于有參考序列的物種,可發現新的轉錄本,完善參考基因集;并鑒定可變剪接、基因融合等結構變異。
此外在基因組研究中,全長轉錄組還可以用于輔助基因組基因注釋
產品優勢
華大特有技術:多倍體通量全長轉錄組和polyA全長轉錄組是華大特有技術。利用UMI技術可以實現準確定量;多倍通量相同數據量可以獲得3-5倍的有效reads,檢測轉錄本數量翻倍;polyA全長轉錄組可以獲得全長polyA尾的長度,可研究其生物學功能。
策略多樣:除常規的全長轉錄組文庫外,還可根據需求增建5-10K大片段文庫,滿足客戶對長轉錄本的研究需求。
通量大:華大基因擁有12臺Sequel測序儀,通量大,測序成本低,周期短。
樣品起始量低:華大基因全長轉錄組樣本需求僅1ug。
信息分析內容全面:實時跟進科學研究前沿,不斷升級信息分析內容。
個性化分析:具有豐富個性化分析經驗,可根據項目需要選擇更適宜的分析軟件,只為保障更精準結果。
無需組裝:長讀長不需要組裝,就可以準確的得到全長轉錄本的序列信息。
精準基因集:借助長讀長測序平臺的優勢獲得更精準基因集,可以改善基因表達定量的結果。
更多新發現:可以發現新的基因和轉錄異構體,并準確的鑒定可變剪接及基因融合現象。
輔助基因注釋:可輔助基因組de novo基因注釋,獲得更好的基因注釋結果。
經驗豐富:華大基因自2015年推出全長轉錄組產品以來,已完成上千個全長轉錄組測序。目前華大基因的Sequel平臺運行良好,實驗及信息分析人員上機及問題處理經驗豐富。