轉錄組即特定組織或細胞在某一功能狀態下所有轉錄本的總和，包括 mRNA 和非編碼 RNA（即Non-coding RNA，如 tRNA，rRNAs，microRNAs，piRNAs 和 long ncRNAs 等）。轉錄組測序 (Transcriptome sequencing) 主要指通過高通量測序研究特定組織或細胞在某個時期轉錄出來的 mRNA，可以用來研究基因結構和基因定量分析，并預測新轉錄本，是深入研究轉錄組復雜性的強大手段和工具。目前，轉錄組測序已經被廣泛應用于動植物發育階段的研究、優良品種基因的篩選和疾病治療等。