FFPE腫瘤組織DNA檢測(cè)服務(wù)

FFPE Tumor Tissue DNA Service

用于個(gè)人化癌癥管理的FFPE腫瘤組織DNA次世代定序分析

服務(wù)類別：	分子與細(xì)胞	總訪問：	609
最后更新：	2020-6-15	半年訪問：	48
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服務(wù)商：東莞上元生物科技有限公司

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服務(wù)介紹
公司簡(jiǎn)介

東莞上元生物科技提供一項(xiàng)ISO15189醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室服務(wù)，給需要研究福馬林固定石蠟包埋（FFPE）腫瘤組織的DNA分子特征現(xiàn)象的醫(yī)生與臨床研究員。我們的能力來自具備FFPE組織的DNA提取全自動(dòng)平臺(tái)、基于PCR的標(biāo)的多工富集技術(shù)、樣本制備、次世代定序以及基因突變分析技術(shù)的支援。此一強(qiáng)大工作流程可提高分析的可追溯性和可重復(fù)性，并加強(qiáng)了癌癥突變研究的質(zhì)量與功效。在個(gè)人化醫(yī)療的新時(shí)代中，針對(duì)可操作突變的序列進(jìn)行定序，對(duì)癌癥診斷、預(yù)后、治療或是監(jiān)測(cè)均具有重要的意義。

樣本需求

人類組織切片：取自10％福馬林固定、石蠟包埋（FFPE）組織塊的3份未染色，帶正電荷的連續(xù)切片。組織固定以6-48小時(shí)內(nèi)的時(shí)間為佳。組織切片厚度建議為4 - 5微米。必須在制備后6周內(nèi)測(cè)定組織切片。
運(yùn)輸：組織切片于室溫下運(yùn)輸。

DNA提取，文庫制備，次世代定序和基因突變分析

DNA提取：從FFPE組織中提取基因組DNA，然后進(jìn)行DNA純化和定量。
文庫制備：將基因組DNA的片段和尺寸化后轉(zhuǎn)換為雙鏈DNA，富集基于PCR的標(biāo)的物、累積擴(kuò)增子（amplicon）進(jìn)行樣本庫制備。
文庫制備：將基因組DNA的片段和尺寸化后轉(zhuǎn)換為雙鏈DNA，再連接寡核苷酸銜接子，并定量樣本庫的產(chǎn)物。
次世代定序：根據(jù)已選的基因，進(jìn)行癌癥突變的靶向測(cè)序。
基因突變分析：利用已發(fā)表的文獻(xiàn)和公共數(shù)據(jù)庫對(duì)癌癥基因突變進(jìn)一步注釋與比較。

分析方法

次世代定序

報(bào)告交付（10個(gè)工作天內(nèi)）
提供一份癌癥基因突變的解釋報(bào)告。

用于辨識(shí)癌癥基因突變的基因
利用次世代定序所得到的癌癥基因突變的基因序列以及基因不同變異中的基因序列
對(duì)癌癥突變的注釋以及其與已知數(shù)據(jù)的比較
按客戶的要求所進(jìn)行另外的突變基因定序

服務(wù)項(xiàng)目/內(nèi)容

癌癥基因	癌癥基因與變異	費(fèi)用
與腫瘤有關(guān)的可操作基因項(xiàng)目 V2	ALK, BRAF, EGFR, ERBB2, ERBB3, ESR1, KIT, KRAS, NRAS, PDGFRA, PIK3CA, RAF1	請(qǐng)洽詢
與腫瘤有關(guān)的可操作基因項(xiàng)目 V3	AKT1, ALK, BRAF, CTNNB1, DDR2, EGFR, ERBB2, ERBB3, ERBB4, ESR1, FBXW7, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FLT3, GNA11, GNAQ, HRAS, KIT, KRAS, MAP2K1, MAP2K2, MET, NOTCH1, NRAS, PDGFRA, PIK3CA, RAF1, SMAD4 ,STK11	請(qǐng)洽詢
客制化的與腫瘤相關(guān)基因項(xiàng)目	依照客戶要求	請(qǐng)洽詢

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