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4D-乙酰化修飾及其他酰化修飾蛋白質組學
蛋白質的乙酰化修飾是在乙酰基轉移酶的作用下,蛋白質的賴氨酸殘基上添加乙酰基的過程,是細胞控制基因表達、蛋白質的活性或生理過程的一種機制。
服務類別:分子與細胞總訪問:10702
最后更新:2023-4-23半年訪問:96
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蛋白質乙酰化修飾由乙酰基轉移酶和去乙酰化酶共同調節,通過感應代謝環境變化而變化,同時其常在代謝酶上發生修飾,進而調控代謝通路及代謝酶的活性,參與下游游代謝物變化。蛋白質乙酰化(acetylation)是最常見的酰化修飾類型,是指在乙酰基轉移酶的催化下把乙酰基團(如乙酰輔酶A等供體)共價結合到底物蛋白質的賴氨酸殘基上的過程,主要發生在蛋白質賴氨酸殘基的ε-NH2位,其分子質量會相應增加42.01Da,質譜能夠準確地測定分子量是否發生相應的質量偏移,實現酰化修飾肽段及位點的分析。4D-labelfree乙酰化修飾蛋白組學是基于timsTOFPro質譜儀,通過數據依賴性采集-同步累積連續碎裂(ddaPASEF)掃描模式進行乙酰化差異蛋白質組學分析。4D-labelfree修飾組,利用了離子淌度分離,能根據分子的形狀、截面積屬性,可有效區分修飾同分異構多肽,極大提高修飾的鑒定深度,以更少上樣量、更快掃描速度,實現蛋白質組學在覆蓋深度、靈敏度、通量方面的全面性提升。

實驗流程
產品類型 修飾位點 富集方法 推薦建議
4D-labelfree乙酰化 Lys Acetyl-Lysine基序抗體 1)微量樣本分析
2)高性價比分析
3)“有無差異”比較,樣本間
表達模式差異較大的實驗設計
4D-labelfree琥珀酰化 Lys Succinyl-Lysine基序抗體
4D-labelfree丙酰化 Lys Propionyl-Lysine基序抗體
4D-labelfree丙二酰化 Lys Malonyl-Lysine基序抗體
4D-labelfree戊二酰化 Lys Glutaryl-Lysine基序抗體
 
應用方向
▶能量代謝調控;
▶代謝綜合征研究;
▶真菌細菌研究。
 
數據分析
標準數據分析內容
蛋白質總鑒定數量分析 蛋白鑒定與定量結果統計、韋恩圖分析、差異結果數量統計、火山圖、聚類熱圖
蛋白質功能分析 亞細胞定位、結構域分析、motif分析、GO功能分析、KEGG通路分析、互作網絡分析
質量控制分析 肽段相對分子質量分布、肽段序列長度分布
 
技術優勢
▶4D技術加持,提高定量的準確性、鑒定深度,更加適合微量樣本;
▶克服標記定量蛋白質組學技術在樣本數量上的限制,靈活方便;
▶基于質譜平臺(BrukertimsTOFpro),檢測速度提升近一倍;
▶經驗豐富——超17年蛋白平臺服務經驗,擁有豐富的高水平項目文章;
▶數據保證——采用進口金標抗體,數據結果穩定可靠;
▶系統解決方案——提供修飾組學至驗證、上下游聯合分析,實現快捷”一站式”服務。
 
推薦組合產品:打通表型-機制研究:乙酰化組+代謝組。
 
參考文獻
1 Sirt3 is a novel target to treat sepsis induced myocardial dysfunction by acetylated modulation of critical enzymes within cardiac tricarboxylic acid cycle. 2020. Pharmacological Research.(IF 7.658) 【客戶文獻】
Lable free乙酰化蛋白組學聯合能量代謝揭示膿毒癥所致心肌功能障礙治療新靶點
2 Extreme Acetylation of the Cardiac Mitochondrial Proteome Does Not Promote Heart Failure. 2020.Circulation Research. (IF 14.5)
Lable free乙酰化蛋白組學助力揭示心力衰竭非線粒體高度乙酰化導致
3 Label-Free Quantitative Proteomics of Lysine Acetylome Identifies Substrates of Gcn5 in Magnaporthe oryzae Autophagy and Epigenetic Regulation. 2018. mSystems. (IF 6.496) 【客戶文獻】
Lable free乙酰化蛋白組學揭示病原菌致病機制
4 Regulation of UCP1 and Mitochondrial Metabolism in Brown Adipose Tissue by Reversible Succinylation. 2019. Molecular Cell.(IF 17.97)
琥珀酰化修飾助力證實酰化修飾在維持能量代謝穩態調節中的重要作用
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