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天河二號超級計算機助力AlphaKnockout基因打靶系統

瀏覽次數:5654 發布日期:2017-7-13  來源:本站 本站原創,轉載請注明出處

如果說發生在2016年春天的人機大戰給圍棋界帶來的是一次不小的震動,那么2017年新年,圍棋界頂尖的人類棋手們算得上經歷了一次“飛蛾撲火”般的悲壯。有人說阿爾法狗就像一臺永動機,在擁有龐大計算能力的谷歌云端不停地練習,永不停歇。這意味著它每一秒、每一天都在進步。

同樣,對于天河二號超級計算機,相信國人再熟悉不過了。連續6次蟬聯全球最快的超級計算機之后,天河二號與神舟、天宮一號、蛟龍號成為國家級名片。天河二號共有16000個運算節點,共312萬個計算核心,其雙精度浮點運算峰值速度達到每秒5.49億億次。在高性能計算、云計算和大數據等方面,“天河二號”都有著大規模的應用。

賽業生物非常榮幸地加入了天河二號不斷擴充的用戶行列并取得重大突破。賽業生物研發的“阿爾法鼠”——AlphaKnockout基因打靶專家系統借鑒“阿爾法狗”永不停歇的深度學習機制,并借助強大的天河二號進行大規模超強度運算,將基因打靶技術制作基因工程鼠的方案設計過程人工智能化。

眾所周知,基因打靶方案的好壞會直接影響基因打靶的效果。以往一個非常熟練的方案設計專家出一份方案需要一到兩個小時,在這過程中,技術人員需要考慮幾十種因素,并且根據這些因素的重要程度進行平衡。即使是經驗豐富的專家,疏漏也在所難免,而且什么方案最優,也基本靠經驗主觀判斷。而用計算機來實現上述人類的智慧活動則有很大優勢。

賽業生物歷經十一年發展,其獨特優勢就是擁有一個由國際頂尖生物技術專家、生物信息學專家和IT技術專家組成的一流團隊,該團隊已成功研發出全球首款基因載體智慧設計平臺VectorBuilder (www.vectorbuilder.com),且已服務全球數萬實驗室。賽業生物的基因打靶專家為生物信息學團隊提供幾十種需要考慮的因素,生物學信息團隊將這幾十種因素當做限制性條件設計計算規則,IT團隊則借助天河二號的超級計算能力利用人工智能算法進行計算,讓設計方案不斷從局部最優向全局最優逼近,從而得到最優方案。更為可貴的是,賽業生物在過去幾年成功完成了數以千例的小鼠和大鼠基因打靶項目,積累了大量可靠的數據來訓練我們的人工智能系統,讓系統進行深度學習,以達到系統參數的最優。這一點類似于阿爾法狗大量學習人類棋譜。

憑借豐富的生物技術領域的智能化軟件設計經驗和高效的團隊合作,賽業生物的技術團隊在短短半年間就成功研發出了人工智能的AlphaKnockout基因打靶專家系統。該系統免費開放以來,已有數千用戶在上面便捷地獲取了基因打靶設計方案。并且,作為開發者的賽業生物承諾永久免費開放使用。

現在,您只需登錄www.alphaknockout.com,輸入需要敲除的基因信息,即可得到設計完善的方案,并且系統會根據生物信息學算法,提供多至三個方案,并按優先次序排序,排第一位的是默認的最優方案。在天河二號的強大運算能力和賽業云端服務器的支持下,整個過程不超過半分鐘。

 

相關公司:賽業(蘇州)生物科技有限公司
聯系電話:400-680-8038
E-mail:info@cyagen.com


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