Immunai(NEBION)策劃了從大塊組織到單細胞的高質量公共轉錄組數據,與高性能但易于使用的工具GENEVESTIGATOR相結合,可以對公開轉錄組數據進行全局和即時分析,以實現新的發現和驗證。
GENEVESTIGATOR涉及多種不同疾病,包括癌癥、自身免疫、纖維化、心血管或代謝疾病。大多數研究來自人類、小鼠和大鼠的數據。
GENEVESTIGATOR使用受控詞匯、領域專家的同行評審、嚴格的質量控制和強大的全球數據集成平臺級標準化的分析工具。
大塊組織(Bulk Tissue)轉錄組數據分析
GENEVESTIGATOR同時分析數千項研究,以找到與藥物或疾病特別相關的基因,或者尋找與基因特征相關的狀況或疾病:
1.有效發現靶標和生物標志物
2.目標和生物標志物的直接優先級排序和驗證
3.創新藥物的再利用和重新定位
4.識別相關實驗模型系統
5.可靠的副作用預測
6.通過干凈的數據有效訓練機器學習算法
7.可靠的數據驅動決策
單細胞轉錄組(scRNA-seq)數據分析
與大塊組織轉錄組數據的管理一致,scRNA-seq數據也是使用受控詞匯、領域專家的同行評審和嚴格的質量控制。此外,還應用了最先進的細胞聚類、批次效應消除以及細胞類型識別和注釋方法,為研究人員提供一致且可用于分析的數據概要。GENEVESTIGATOR由人類和小鼠scRNA-Seq數據組成,并提供不同的數據格式,供研究者使用喜歡的分析工具進行探索。
GENEVESTIGATOR現在可以使用其用戶友好的可視化工具對來自公共存儲庫的深度策劃的單細胞RNA-Seq數據進行分析。其獨特的高質量和深度整理的數據集合使研究人員能夠了解發育和疾病的分子機制,并揭示正常和患病組織中的細胞異質性。概要中一致的處理、管理、聚類、細胞類型識別和研究協調使用戶能夠節省時間和資源,并專注于解決跨越不同治療領域的令人興奮的問題。
1.獲得全球范圍內單細胞異質性的高分辨率視圖
2.揭示復雜和稀有的細胞群
3.追蹤不同細胞譜系在發育過程中或對刺激的反應軌跡
4.揭示細胞類型水平的調控關系以改進靶標發現
5.確定細胞類型特定疾病與生物標志物開發的關聯
6.可靠的數據驅動決策
GENEVESTIGATOR以下領域的數據可用,每個領域都包含基線開創性研究和更具體的研究:
1.心血管系統
2.消化和內分泌系統
3.免疫系統
4.神經系統
5.腫瘤學
6.生殖和腎臟系統
7.呼吸系統
8.各種系統(目前有來自骨關節炎、皮膚科等的數據)
【點擊查看】GENEVESTIGATOR案例:對10x RNA-Seq數據集的分析
【點擊查看】GENEVESTIGATOR:單細胞轉錄組學數據分析
講座主題:
利用GENEVESTIGATOR探索組織和單細胞轉錄組數據中的基因表達譜
講座時間:
5月22日(周三)16:00-17:00
主講嘉賓:
Frank Staubli博士
軟件介紹:
GENEVESTIGATOR是基因表達的高性能搜索引擎。它集成了上萬由專家人工統一精選、注釋與歸一化的公共大塊組織和單細胞實驗結果,將基因在不同的生物環境中,如疾病、藥物、組織部位、腫瘤、細胞系或基因型中的表達進行了可視化,以探索不同生物環境下不同基因的表達情況以及基因與生物環境的潛在深層聯系。
報名方式:
掃描下方二維碼填寫報名信息
注:報名截止日期為5月20日。入會鏈接(Zoom)將于5月20日發送至您報名的郵箱,如未收到請聯系我們!
關于本次會議的任何問題可聯系康昱盛官方客服: