txyz.ai助力EAD:SCIEX發布AI釋讀7600系統新應用案例

瀏覽次數：2553　發布日期：2023-11-17　來源：SCIEX

SCIEX高分辨質譜 ZenoTOF^® 7600 系統自2021年發布以來，各種學科的科學家利用其新型的電子活化解離(Electron Activated Dissociation, EAD)技術結合Molecule Profiler和Biologics Explorer等數據處理軟件，在生物藥、脂質分子，代謝組學、脂質生物標志物等方面促進了科學研究。尤其在分子結構解析、糖苷類代謝位點確證、脂質分子中雙鍵的定位，離子型脂質降解產物的鑒定等應用方向，提供了非常可靠的高分辨質譜數據。我們精選了4篇新進EAD應用案例，論文原文語言為英文，共計22頁。近日，該內容經匯總正式上線，可免費下載。

想了解EAD的新進應用，難道必須要讀完22頁英文論文？這需要花費不少的時間和精力。

遇事不決，可問txyz.ai和SCIEX。介紹一個好用的讀學術內容的工具(txyz.ai)，可以直接在瀏覽器輸入txyz.ai登陸。我們用AI釋讀這4篇應用案例，然后，又請了 SCIEX專家從質譜和軟件的角度釋讀案例。只把簡潔的精華技術內容呈現給您。

掃描二維碼，下載新進EAD應用案例

應用案例1.

抗體藥物偶聯物(ADC)抗體比(DAR)測定

SCIEX專家從質譜和軟件的角度釋讀

使用ZenoTOF 7600 系統對恩美曲妥珠單抗 (T-DM1) 的糖基化和去糖基化形式進行了表征，然后使用Biologics Explorer軟件進行了自動數據分析 (上圖)，從而實現了精確的DAR測量。糖基化 (天然) 和去糖基化形式的曲妥珠單抗 (T-DM1) 的平均DAR值分別為3.6和3.5。糖基化T-DM1的MS譜由不同的質荷比組成，主要是G0F、G1F和G2F 與多達8個有效質荷比DM1偶聯分子，去除N連接的糖基化則有更簡單的MS譜，其中檢測到去糖基化的T-DM1攜帶多達8個DM1。

利用ZenoTOF 7600 系統的EAD功能，進行精確的完整質量測量和由Biologics Explorer軟件提供的自動數據注釋，可快速進行蛋白質鑒定和DAR測定。

AI釋讀

這篇論文介紹了使用LC-MS分析完整的糖基化和去糖基化ADC樣品的過程。研究使用Waters ACQUITY BEH C4柱和Exion LC AD系統對樣品進行分離，LC運行的流速為0.3毫升/分鐘，柱溫保持在60攝氏度。質譜分析使用ZenoTOF 7600 系統進行，數據處理則使用Biologics Explorer軟件。研究結果顯示，通過這種組合可以準確測量和自動解釋完整ADC的分析數據。對T-DM1的糖基化和去糖基化形式進行了DAR值測定，分別為3.6%和3.5%。研究還指出Biologics Explorer軟件提供了簡化的工作流程，可用于確定ADC的藥物-抗體比（DAR）。總體而言，該研究展示了使用LC-MS和Biologics Explorer軟件進行完整ADC分析的可行性和有效性。

應用案例2.

離子型脂質納米顆粒DODAP及其降解產物的自動表征

SCIEX專家從質譜和軟件的角度釋讀

本工作展示了離子型脂質體1,2-二磺酰-3-三甲基銨丙烷 (DODAP) 在降解和氧化過程中的綜合表征。EAD產生大量的診斷離子，這些離子在單電荷脂質的碰撞誘導解離 (CID) 模式下，呈現得并不好，但對結構注釋很重要。Molecule Profiler軟件通過自動注釋信息豐富的基于EAD的MS/MS數據，提供結構解析。這個工作流程有助于理解在脂質納米顆粒 (LNP) 配方中使用的離子型脂質的降解規律。

Molecule Profiler軟件顯示DODAP降解物結構表征。圖A顯示了m/z 384.3的EAD MS/MS譜圖，展示了高置信度的鑒定和結構解析。當一個峰被分配給一個選擇的的結構或分子式時，該峰值將以淺藍色顯示。圖B顯示了圖A中給出的質譜對應的結構。圖C顯示了與圖B中匹配的結構相對應的已選碎片離子列表。

EAD技術生成豐富的MS/MS數據，對DODAP、氧化形式及其降解物進行了可靠的鑒定，具有優異的質量精度，Molecule Profiler軟件加快了自動識別、確定結構和相對定量DODAP及其相關雜質的過程。

AI釋讀

這篇論文介紹了使用ZenoTOF 7600 系統和Molecule Profiler軟件對DODAP及其降解產物和氧化形式進行反相LC-MS分析的結果。色譜分離顯示DODAP的主峰在15.5分鐘處，未經處理的DODAP樣品中存在多個降解產物，其中主要的降解峰在3.15分鐘處。研究結果表明DODAP易于降解。Molecule Profiler軟件被用于識別DODAP雜質，并自動確定每個雜質的相對豐度。通過高分辨率的ZenoTOF 7600 系統，實現了出色的質量準確度。研究還使用EAD MS/MS譜圖和Molecule Profiler軟件對DODAP及其降解產物和氧化形式的結構進行了詳細表征。該研究提供了一種完整的離子化脂質特性分析解決方案，并可以用于藥物療效和安全性評估以及新合成脂質的設計。

應該案例3.

碰撞誘導解離(CID)和電子活化解離(EAD)技術對藥物代謝物鑒定

SCIEX專家從質譜和軟件的角度釋讀

在藥物發現的早期階段，對肝微粒體測定來研究代謝清除率和代謝位點。ZenoTOF 7600 系統和Molecule Profiler軟件的代謝物鑒定工作流程，快速易用的工作流程生成信息數據，加快了早期藥物發現過程。

上圖顯示使用Molecule Profiler軟件自動化的結構解析，確認兩種結合型生物轉化物，包括去甲基化福莫特羅的代謝物及進一步的葡萄糖醛酸代謝物的結構鑒定，EAD的質譜數據能明確地確定葡萄醛酸代謝的途徑。

ZenoTOF 7600 系統上的Molecule Profiler軟件，可以對I相、II相和多種生物轉化物代謝物進行自動結構分配。可靠的代謝物鑒定使用EAD MS/MS譜圖、CID MS/MS譜較長或兩者結合的獨特離子進行分析。

AI釋讀

這篇論文介紹了使用ZenoTOF 7600 系統和Molecule Profiler軟件進行代謝物鑒定的軟件輔助過程。該方法結合了CID和EAD數據，增加了代謝物結構鑒定的可信度。研究使用了ZenoTOF 7600 系統和Molecule Profiler軟件生成了信息豐富的數據，加速了早期藥物發現過程。

論文中提到，利用LC-MS工具進行微粒體測定可以估計代謝清除率和鑒定代謝位點。通過使用ZenoTOF 7600 系統和Molecule Profiler軟件的先進代謝物鑒定工作流程，可以快速、簡便地生成有用的數據，加速早期藥物發現過程。

Molecule Profiler軟件可以識別治療分子中的生物轉化。最新的更新使得該軟件可以根據EAD和CID數據對生物轉化的結構進行優先排序，非常適合比較MS/MS光譜并識別獨特的片段。使用ZenoTOF 7600 系統和Molecule Profiler軟件進行代謝物研究的關鍵特點包括增強的結構鑒定、可靠的結構鑒定、快速的代謝物鑒定和簡化的數據采集和處理工作流程。

論文中還介紹了樣品制備、色譜條件和質譜條件等實驗方法。通過使用Zeno CID DDA和Zeno EAD DDA數據，結合Molecule Profiler軟件，可以鑒定出相位I、相位II和生物轉化組合代謝物。軟件可以直接從SCIEX OS軟件的Explorer模塊導入MS/MS光譜，并進行結構鑒定。

論文的結論包括自動化的結構鑒定、利用Molecule Profiler軟件識別EAD和CID MS/MS光譜中的獨特片段、快速高效的軟件輔助代謝物鑒定和相關分析、以及該工作流程的適應性和可擴展性。

總之，這篇論文介紹了使用ZenoTOF 7600 系統和Molecule Profiler軟件進行代謝物鑒定的方法和工作流程，并展示了其在早期藥物發現中的應用潛力。

應用案例4.
精確質譜法鑒定脂質生物標志物

SCIEX專家從質譜和軟件的角度釋讀

本工作描述了測定小鼠腦基質中葡萄糖基和半乳糖基神經酰胺的高分辨質譜方法。小鼠大腦含有許多內源性脂質生物標志物，這些標志物具有相似的結構，干擾非常普遍；分析揭示了新的干擾或在治療組之間增加或減少的干擾。這些數據充分展示了潛在的生物標記物是如何識別的，可以獲得更多關于目標樣本的信息，有助于將這些物種作為其他潛在的生物標志物進行表征。

ZenoTOF 7600 系統是一種可以用于脂質生物標志物定性和定量分析的利器，具有高靈敏度和準確性。

AI釋讀

這篇論文介紹了使用SCIEX OS軟件平臺中的Formula Finder和ChemSpider工具來進行化合物鑒定的方法。通過準確質量TOF MS數據，Formula Finder確定可能的分子式，然后ChemSpider在其數據庫中搜索與所提出的分子式匹配的條目。最后，ChemSpider生成一個命中計數，總結與前體質量和同位素譜圖確定的分子式匹配的數據庫條目數量。根據命中計數，用戶選擇最合適的分子式，并將其與數據庫中的命中進行匹配。然后，通過比較理論碎片與收集到的MS/MS數據，提供碎片的百分比匹配，最終由用戶做出最終選擇。該方法在小鼠腦樣本中鑒定干擾物和化合物的過程中展示了良好的效果。此外，論文還介紹了使用ZenoTOF 7600 系統進行脂質生物標志物的敏感定量分析的方法，并展示了其在低樣本體積下實現高靈敏度的能力。最后，論文總結了該方法的優點，包括簡單易行的樣品鑒定和定量分析，以及在SCIEX OS軟件提供的單一平臺上實現的數據采集、處理和管理。