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代謝組學及網絡藥理學研究技術與實踐培訓班通知

瀏覽次數:1334 發布日期:2023-7-5  來源:本站 本站原創,轉載請注明出處

代謝組學是近年發展快速的一門學科,目前在醫學、植物學、微生物學、毒理學、藥物研發等多個領域中得到了廣泛的應用。如何從復雜的代謝組學數據中提取出有價值的信息,篩選出潛在的生物標志物成為近年來代謝組學研究的熱點和難點。網絡藥理學能夠通過計算機模擬算法、運用組學、高通量篩選及網絡分析等技術揭露藥物-靶點-疾病之間復雜的網絡信號關系,已經成為揭示生物系統復雜功能和行為的有力工具。
 
課程特點:

實操干貨,實際一線工作者的經驗分享,在較短時間全面了解網絡藥理學與代謝組學技術相結合的概念,熟悉相關操作流程,明確流程中的關鍵點和易出錯點,避免觸碰雷區或走入誤區,提供詳實的方法資料,借助較流行的在線數據庫及Cytoscape軟件(無需編程),對網絡藥理學進行系統性學習(數據獲取,網絡構建,通路分析)及個性化問題解決,同時結合代謝組學數據進行整合分析,實現多技術交叉和多數據融合的高級數據解析思路和方案。
 
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課程安排:
 
日期 時間 授課題目 授課內容
7月8日 9:00-12:00 代謝組學研究技術與實踐 1、代謝組學研究思路和流程,全局了解代謝領域新方向
1.1 代謝組學概述
1.2 代謝組學樣本的采集、保存與制備的注意事宜
1.2 代謝組學的應用
2、代謝組學數據采集與預處理,決定數據統計結果的準確性
2.1 代謝組學相關平臺介紹
2.2 常用軟件和數據庫介紹(數據采集、數據預處理、代謝物鑒定)
2.3 數據預處理與分析
3、基于SIMCA-P軟件的代謝組學數據多元統計分析與實操
3.1 樣本分類(PCA、PLS-DA、OPLS-DA)
3.2 差異變量篩選(S-plot、S+V-plot、VIP等)
3.3 常見圖形結果解讀
12:00-14:00 午間休息
14:00-17:00 網絡藥理學研究技術與實踐 4、網絡藥理學研究思路和流程
5、網絡藥理學數據分析與實操
5.1 化學成分的獲取與篩選(Pubchem、TCMSP數據庫、TCMID數據庫、Swiss ADME數據庫等)
5.2 中藥化學成分靶點獲取(TCMSP數據庫、BATMAN-TCM數據庫、Similarity Ensemble Approach (SEA)數據庫、Swiss Target Prediction數據庫、HIT2.0、HERB等)
5.3 疾病靶點富集數據庫(DisGeNET數據庫、GeneCards數據庫、OMIM數據庫等)
5.4 化合物與疾病靶點映射(韋恩圖)
5.5 PPI網絡分析(PPI網絡構建、網絡拓撲特征的計算、網絡拓撲指標的含義、重要節點識別)
5.6 富集分析(DAVID數據庫、Metascape數據庫、KOBAS數據庫)
5.7 通路可視化分析工具(氣泡圖、柱狀圖)
5.8 靶點組織定位分析
5.9 網絡圖構建—Cytoscape(數據導入、節點關系的建立、節點屬性計算、調整網絡樣式、篩選及過濾、網絡圖導出)
5.10 分子對接 
7月9日 9:00-12:00 代謝組學與網絡藥理學結合研究技術與實踐 6、為什么要在網絡藥理學中結合中藥代謝組?
7、代謝組學與網絡藥理學結合研究思路
8、代謝組學與網絡藥理學結合分析技術
8.1 代謝組學與網絡藥理學數據的獲取(HMDB數據庫、成分靶點獲取、疾病靶點富集數據庫、 代謝專屬數據庫)
8.2 代謝組學功能分析(富集分析、通路分析等)
8.3 代謝小分子網絡關聯分析(Metscape軟件、OmicsNet數據庫)
8.4 代謝物-代謝物網絡的構建與分析
8.5 代謝組學與網絡藥理學功能層次關聯分析
12:00-14:00 午間休息
14:00-17:00 文獻解讀及實例解析 9、文獻解讀:代謝組學與網絡藥理學結合的文章分析流程和套路
9.1 中藥化學成分靶點與代謝小分子網絡分析實例(Food Res Int.2020,136:109503)
創新點:采用Metscape軟件對代謝組學發現的差異代謝物和中藥成分的藥物靶點關聯,聚焦關鍵蛋白。
9.2 代謝組學與網絡藥理學功能層次關聯分析實例(JEthnopharmacol.2021,264:113281. )
創新點:采用功能富集工具分別對網絡藥理學和代謝組學數據進行關聯,聚焦關鍵通路。
9.3代謝組學和網絡藥理關聯分析實例(Comput Struct Biotechnol J.2021,19:1002-1013)
創新點:整合代謝組學和網絡藥理學,從代謝小分子網絡和代謝組學功能分析出發,多維度聚焦關鍵通路和關鍵蛋白。
10、實例解析與練習
11、代謝組學與網絡藥理學結合文章寫作規范
12、《網絡藥理學評價方法指南》解讀
13、代謝組學與網絡藥理學結合項目設計解析
 
 
主講專家:

本次課程由工作在科研一線的老師(講師)擔任主講,在國內外學術期刊發表研究論文57篇,其中SCI收錄16篇。近幾年主持/參與國家自然科學基金和省自然科學基金多項。從事代謝組學和網絡藥理學技術研究近十年,熟練相關技術流程和操作方法,研究方向為中藥網絡藥理學及中藥代謝組學。

會議費用:
會議費3000元/人,同一單位3人以上參會優惠至2800元/人。此次課程為線上直播教學模式,開課前統一提供配套電子版培訓資料。參加培訓的學員課后可通過微信群繼續和授課講師交流,長期獲得指導機會。
 
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會議咨詢:
章老師 13121195178(微信同號)
E-mail:info@huasitai.com
 
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