日期

主題

課程內(nèi)容

7-23

上午

R在測序數(shù)據(jù)分析和應用簡單介紹

測序基礎知識,不同組學數(shù)據(jù)基礎分析介紹（轉(zhuǎn)錄組，甲基化）

R語言基礎知識

R語言安裝，R包安裝和幫助文檔查看

7-23

下午

R語言的編程

數(shù)據(jù)結構和數(shù)據(jù)清洗

數(shù)據(jù)的導入導出

常用的控制語句

R語言繪圖

ggplots繪圖基本使用

SCI級圖片繪制

7-24

上午

R在生物信息分析中的統(tǒng)計應用

基本統(tǒng)計分析（頻數(shù)統(tǒng)計,相關性分析,t檢驗）

主成分分析（PCA），聚類分析（heatmap cluster）,ANOVA方差分析

生存分析

7-24

下午

R分析轉(zhuǎn)錄組測序?qū)嵗龜?shù)據(jù)

edgeR包轉(zhuǎn)錄組測序差異分析

差異基因火山圖，散點圖繪制

R進行基因的GO富集分析和Pathway分析

頒發(fā)結業(yè)證書，合影留念

日期

主題

課程內(nèi)容

7-25

上午

技術介紹

單細胞RNA測序技術平臺，原理介紹

單細胞RNA測序的應用及案例分析

7-25

下午

樣本制備

單細胞懸液制備的解決方案

單細胞懸液制備demo實驗

常見樣本單細胞懸液制備經(jīng)驗交流

7-26

上午

分析方法

單細胞RNA測序示例報告解讀

單細胞RNA測序常用分析方法介紹

分析實操

常用分析軟件的操作

常用作圖方法

高級分析的思路和方法

頒發(fā)結業(yè)證書，合影留念

空間轉(zhuǎn)錄組培訓班

日期

主題

課程內(nèi)容

7-27  

上午

空間轉(zhuǎn)錄組項目設計

空間轉(zhuǎn)錄組發(fā)展歷程，測序流程及原理介紹

空間轉(zhuǎn)錄組測序高分文章匯總和案例解析

7-27

下午

實驗原理及R語言入門

空間轉(zhuǎn)錄組實驗原理介紹及實操

R語言入門（常用語法，數(shù)據(jù)類型，結構）

7-28

上午

空間轉(zhuǎn)錄組分析流程及結果解讀

10x Visium官方軟件Space Range結果解讀

使用Seurat包進行空轉(zhuǎn)分析的流程實操及結果解讀

7-28

下午

軟件使用及數(shù)據(jù)挖掘

Loupe Browser介紹及安裝

使用Loupe Browser進行數(shù)據(jù)挖掘及可視化

頒發(fā)結業(yè)證書，合影留念