單細胞轉錄組測序及生信分析培訓班報名通知
單細胞測序技術近年屢次被評為生物科研熱點，文獻發表也呈現迅猛增長趨勢。Nature期刊最近評出2019年最值得期待的7項生物技術，擴展單細胞生物學（Expand single-cell biology）位列其中之一。SBC引進的10x Genomics Chromium™平臺，基于GemCode™微流控技術進行單個細胞分選，可一次性獲得大量單細胞的基因表達數據，從而達到在單細胞水平進行表達測序的目的。
為幫助科研工作者深入了解單細胞測序技術，SBC茲定于2019年6月28-29日在上海生物芯片有限公司/生物芯片上海國家工程研究中心舉辦單細胞轉錄組測序及生信分析培訓班。希望通過此次培訓讓學員全面了解單細胞測序技術的實驗原理、應用，并上機模擬操作Demo數據的生信分析等。誠邀報名參加，本次培訓班實行小班制（限額20人，報滿截止）。
主辦單位：上海生物芯片有限公司/生物芯片上海國家工程研究中心
培訓日期：2019年6月28日-29日
培訓地點：上海市浦東新區張江高科技園區李冰路151號1號樓
培訓地點：上海市浦東新區張江高科技園區李冰路151號1號樓
一、日程安排：
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時間 |
主題 |
課程內容 |
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6月28日 |
單細胞測序技術介紹 |
單細胞測序技術的發展及10Xgenomic單細胞測序原理介紹 |
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樣本準備 |
單細胞樣本準備及常見問題 | |
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Demo實驗 | ||
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R語言基礎 |
R基本概念：向量、數組和矩陣、函數；R從文件讀取數據、根據需要編輯、轉換數據結構；文件圖表等的生成導出 | |
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10X單細胞轉錄組分析流程及原理介紹 |
Cellranger運行環境、服務器配置，如何從fastq生成表達矩陣等系列結果；Seurat的使用、算法解析等 | |
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10X單細胞轉錄組分析上機操作 |
在R交互環境運行Seurat、向量準備、畫圖函數使用、數據結構解剖處理等；R畫圖包括PCA、tSNE、VlnPlot、PCHeatmap等 | |
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6月29日 |
單細胞轉錄組結果報告解讀 |
單細胞轉錄組結果報告解讀 |
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10X單細胞ATAC-seq分析流程及原理介紹 |
cellranger-atac運行、運行過程中使用算法介紹及結果解讀 | |
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10X單細胞ATAC-seq分析上機操作 |
Loupe Cell Browser軟件運行、ChIPseeker對peaks結果注釋、Cicero介紹 | |
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單細胞高級分析 |
Monocle的原理算法介紹；
高分文章案例數據集作圖：擬時序、譜系分析等 | |
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單細胞測序技術的應用與實驗設計思路解析 |
單細胞測序技術的應用與實驗設計思路解析 |
二、費用及優惠：
1、培訓費用：2000元/人，包含培訓費、資料費、培訓期間午餐費。
2、報名優惠：
· 所產生的培訓費用可在后續訂購SBC服務產品時抵扣等額的合同款項（每份服務合同只能抵扣一人培訓費用），有效期至2019年12月31日為止。
· 團體報名（同一單位2人及以上）享受9折優惠價。
· 以上2項優惠條件可同時享受。
3、其他說明
· 以匯款憑證(截圖、掃描件)或實際到款為成功報名
· 學員需自己攜帶筆記本電腦參加上機課程（電腦配置及軟件要求：報名成功后通知）。
· 早晚餐、交通及住宿費用等請自理。
三、報名方式：
四、匯款信息：（匯款時請注明：培訓班+姓名）
名稱：上海生物芯片有限公司
開戶行：中國銀行上海浦東分行
賬號：4572 5921 5312
五、報名咨詢：
上海生物芯片有限公司/生物芯片上海國家工程研究中心
2019年5月21日
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