方案一、利用SBC-Roche Nimblegen芯片服務平臺進行微生物研究

作為Nimblegen芯片在中國的技術服務供應商,上海生物芯片有限公司/生物芯片上海國家工程研究中心(SBC)將為您提供
“系統而全面的Nimblegen微生物芯片技術解決方案”。
Roche公司的Nimblegen芯片產品使用等溫探針(Isothermo Probe)的設計方法,可保證實驗的穩定性、消除雜交假象和偏差。在整個系統中,對探針長度進行優化選擇(24-85mer),調整到均一的解鏈溫度(76℃),保證在特定的基因區域,包括在富含AT或GC的區域能達到一致的解鏈溫度。Nimblegen芯片產品具有靈活的芯片格式,可選擇385K、4×72K、12×135K等多種格式。
SBC可利用NimbleGen芯片平臺為您提供目前市場上品種最全(幾百種)的微生物芯片技術服務
Organism | Accession | Genes | Average Probes/Gene | Density | Replicates |
Acinetobacter sp. ADP1 | NC_005966 | 3,325 | 14 | 192,000 | 4 |
Aeropyrum pernix K1 | NC_000854 | 1,841 | 20 | 192,000 | 5 |
Agrobacterium tumefaciens str. C58 | NC_003304,
NC_003305 NC_003306, NC_003308 | 5,402 | 14 | 385,000 | 5 |
Agrobacterium tumefaciens str. C58 | NC_003062, NC_003063 NC_003064, NC_003065 | 5,288 | 18 | 385,000 | 4 |
Anabaena variabilis ATCC 29413 | NC_007410,
NC_007411 NC_007412,
NC_007413 | 5,657 | 17 | 385,000 | 4 |
Anaplasma marginale str. St. Maries | NC_004842 | 949 | 20 | 192,000 | 5 |
Aquifex aeolicus VF5 | NC_000918,
NC_001880 | 1,560 | 20 | 192,000 | 5 |
(以上為部分產品及服務目錄,具體請查詢Nimblegen公司網站,http://www.nimblegen.com)
方案二、利用SBC-Roche個性化定制平臺進行微生物芯片定制
在不斷打造點樣芯片技術為廣大客戶提供個性化定制服務的基礎上,上海生物芯片有限公司(SBC)與Roche公司一起聯合推出原位合成技術個性化芯片定制升級方案。
您只需提供微生物的基因組序列信息或EST序列信息,我們即可設計并制作原位合成的表達譜芯片(推薦4*72格式),時間僅需兩個月。與傳統方案相比,免去了oligo合成所需的大量費用,也免去了文庫測序所需的大量費用和大量克隆PCR等繁重的工作,且產品質量更加穩定可靠。
• 國際化制作標準:Nimblegen專利原位合成技術進行芯片制作,確保芯片質量嚴格遵循Roche公司芯片生產質量標準,確保與商業化芯片完全一致的品質。可以對任何已知基因組序列或EST 序列的物種進行精準探針設計。
• 流程簡化、成本降低:無需預先合成探針,無需花費成本進行繁瑣的搖菌、抽質粒、PCR、純化等步驟。
• 更加自由:不受克隆限制,沒有克隆,照樣制作。
• 不受物種限制:可以對任何有背景信息的物種設計制作芯片并完成服務。
• 多種芯片格式可供選擇:可選擇385K、192K、4×72K、12×15K等多種芯片格式。
方案三、利用新一代測序技術-454深度測序進行微生物基因組研究
上海生物芯片有限公司/生物芯片上海國家工程研究中心(SBC)與南方基因組研究中心攜手,利用GS FLX系統,為您提供454深度測序服務。
Roche GS FLX是世界上第一個可以提供超高通量基因組和長片段DNA測序的商業化系統設備,通過GS FLX的納米技術、微流體技術和微陣列技術,拼接超高通量的DNA片斷得到完整的基因組,速度為每小時600萬個堿基。 一個研究人員使用一臺儀器就能在100天內輕松地完成30億對人類基因的排序。
GS FLX系統具備的卓越性能
• 一個測序反應耗時7.5個小時,獲得超過1億個的堿基數據;
• 單個序列的讀長更長,平均可達到250-300堿基左右;
• 通量更高,每個反應可以得到超過40萬個序列讀長,成本大大降低;
• 讀長超過200 bp時,單一讀長的準確性可以超過99.5%;
• 測序結果一致性超過99.99%;
• 技術成熟,提供完整的解決方案;
• 可以進行Pair-End 測序研究。
我們的成功案例:
1、與上海交通大學醫學院合作開展了問號勾端螺旋體無毒株(4.3Mb)的測序;
2、與西安藥廠合作進行了α-溶血性鏈球菌(2-3 Mb) 的測序;
3、與中科院植生所合作進行了厭氧梭菌(3.9-4.2Mb)的測序;
4、與上海交通大學生科院合作進行了鏈霉菌(8-10Mb)的測序;
SBC與Roche聯合促銷,共同讓利。以推動微生物領域高通量研究的積極進展。
促銷時限:2008年11月1日—2008年12月31日。
促銷條件:以上期限內與SBC簽定Nimblegen芯片委托服務協議并支付首付款的客戶。
促銷產品:現有的幾百種微生物基因組表達譜芯片產品(僅限4×72K格式:每個slide上有4個array)。
促銷內容:符合上述條件的項目,實驗樣品數為4的倍數的,每個樣品(客戶提供合格的總RNA)收費
5500元人民幣。
促銷結束后,價格恢復原價。
技術服務熱線:800-820-3665、800-820-5086,021-51320268
技術服務網站:http://
上海生物芯片有限公司
http://www.shbiochip.com
地址:上海張江高科技園區李冰路151號
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電話:+86-21-51320268
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